Prvýkrát sa myšlienka zriadiť vysokú školu veterinárneho vzdelávania na Slovensku objavila v roku 1939, ale k jej naplneniu došlo až po druhej svetovej vojne. Vysoká škola veterinárska v Košiciach bola založená v roku 1949 a dodnes je jedinou vysokou školou pre tento typ vzdelávania na Slovensku.
Dňa 30. 9. 1949 sa uskutočnili prijímacie pohovory a 3. októbra 1949 bol zápis do 1. ročníka.
V roku 1952 došlo k zlúčeniu VŠV s Poľnohospodárskou fakultou Vysokej školy poľnohospodárskej a lesníckej, pričom v Košiciach vznikla Veterinárska fakulta Vysokej školy poľnohospodárskej v Nitre.
Akademici tejto fakulty sa snažili o prinavrátenie samostatnosti, čo sa podarilo v roku 1968 schválením zákona o zriadení Vysokej školy veterinárskej v Brne a v Košiciach.