Univerzita Pavla Jozefa Šafárika
Významné výročie založenia Košickej univerzity, ktoré pripadlo na rok 1957, podnietilo zriadenie Jubilejného výboru pre oslavy 300. výročia založenia Košickej univerzity (1955 – 1957). Výbor, ktorý tvorili významné osobnosti vedeckého a kultúrneho života Košíc, sa snažil o spojenie historického odkazu a univerzitnej tradície v meste s úsilím o založenie novej univerzity v Košiciach. Výsledkom zasadaní Jubilejného výboru bolo Memorandum z roku 1957, ktoré zdôrazňovalo historickú tradíciu Košickej univerzity a jej prepojenie na vtedajšie vysoké školy a vyzdvihovalo potrebu založenia univerzity na východnom Slovensku. Vrcholné štátne, stranícke a krajské orgány síce súhlasili so zriadením univerzity v Košiciach od akademického roka 1957/1958, avšak z ideologických dôvodov odmietli odkaz na historickú tradíciu jezuitskej univerzity.
V tom období pôsobili v Košiciach dve detašované fakulty: Lekárska fakulta Univerzity Komenského v Bratislave a Veterinárska fakulta Vysokej školy poľnohospodárskej v Nitre. Filologická fakulta Vysokej školy pedagogickej v Prešove bola taktiež detašovanou fakultou Vysokej školy pedagogickej v Bratislave.
Úsilie Jubilejného výboru sa naplnilo prijatím vládneho nariadenia dňa 12. augusta 1959, ktoré ustanovilo novú univerzitu týmito slovami: „zriaďuje sa Univerzita v Košiciach s fakultou lekárskou v Košiciach a s fakultou filozofickou so sídlom v Prešove. Lekárska fakulta sa zriaďuje z Pobočky Lekárskej fakulty Univerzity Komenského v Bratislave so sídlom v Košiciach, Filozofická fakulta sa zriaďuje z Filologickej fakulty Vysokej školy Pedagogickej v Bratislave so sídlom v Prešove.“
Nová univerzita, ktorej názov bol stanovený vládnym nariadením z 24. novembra 1959 na „Univerzita Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach“, bola slávnostne otvorená dňa 1. septembra 1959. Prvým rektorom UPJŠ sa stal prof. MUDr. Jozef Pajtáš, okrem neho boli menovaní dvaja prorektori (doc. MUDr. Imrich Ivančo za Lekársku fakultu a doc. PhDr. Tibor Halečka za Filozofickú fakultu).
Súčasťou UPJŠ sa v roku 1964 stala Pedagogická fakulta so sídlom v Prešove a v roku 1973 novozriadená Právnická fakulta.
V 90. rokoch sa súčasťou UPJŠ stali novozriadené bohoslovecké fakulty (Gréckokatolícka bohoslovecká fakulta a Pravoslávna bohoslovecká fakulta), obe so sídlom v Prešove.
Významnou udalosťou v dejinách univerzitného vzdelávania na východnom Slovensku bolo rozdelenie UPJŠ na dve univerzity zákonom č. 361/1996 Z. z. Súčasťou UPJŠ ostala Lekárska, Právnická a Prírodovedecká fakulta, ktoré dovtedy sídlili v Košiciach. Filozofická, Pedagogická a bohoslovecké fakulty so sídlom v Prešove sa stali súčasťou novozaloženej Prešovskej univerzity v Prešove. V roku 1998 sa UPJŠ rozšírila o Fakultu verejnej správy. Ako posledná bola založená Filozofická fakulta v roku 2007, čím sa dotvorila štruktúra UPJŠ ako univerzity so zastúpením všetkých tradičných univerzitných fakúlt.